Выпуски >Вестник Самарского государственного университета. Естественнонаучная серия > Вестник СамГУ № 3 (114) - 2014

Вестник СамГУ 2014. № 3 (114). С.178-186.

УДК 575.224.2

Концевая И.С. Николаевский В.В. Макурина О.Н.

РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ПОЛИМОРФИЗМОВ В ГЕНАХ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ВИРУЛЕНТНОСТЬЮ, СРЕДИ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS В САМАРСКОЙ ОБЛАСТИ


Аннотация. В работе рассмотрена распространенность полиморфизмов в генах Mycobacterium tuberculosis, ассоциированных с вирулентностью, их связь с генетическими группами, кластерами штаммов и лекарственной чувствительностью. Обнаружены ассоциации между полиморфизмами в гене plcA и рядом кластеров семейства штаммов LAM, в генах dosT и pks15/1 и семейством Beijing, а также в гене lipR с большинством кластеров групп Ghana, Cameroon, Uganda и S. Выявленная взаимосвязь между изученными полиморфизмами и чувствительностью к препаратам носит опосредованный характер.

Ключевые слова: туберкулез, молекулярная эпидемиология, генотипирование, вирулентность, лекарственная устойчивость.;

Библиографический список

  • 1. Туберкулез в Российской Федерации, 2010 г. Аналитический обзор статистических показателей, используемых в Российской Федерации. М., 2011. 280 c.
  • 2. Induction of a novel class of diacylglycerol acyltransferases and triacylglycerol accumulation in Mycobacterium tuberculosis as it goes into a dormancy-like state in culture / J. Daniel [et al.] // J. Bacteriol. 2004. V. 186. № 15. P. 5017–5030.
  • 3. Analysis of genetic polymorphisms affecting the four phospholipase C (plc) genes in Mycobacterium tuberculosis complex clinical isolates/ C. Viana-Niero [et al.] // Microbiology. 2004. V. 150. № 4. P. 967–978.
  • 4. Insertion- and deletion-associated genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis phospholipase C-encoding genes among 106 clinical isolates from Turkey / S. Talarico [et al.] // J. Clin. Microbiol. 2005. V. 43. № 2. P. 533–538.
  • 5. Phospholipases C are involved in the virulence of Mycobacterium tuberculosis / C. Raynaud [et al.] // Mol. Microbiol. 2002. Т. 45. № 1. С. 203–217.
  • 6. Identification of variable regions in the genomes of tubercle bacilli using bacterial artificial chromosome arrays / S.V. Gordon [et al.] // Mol. Microbiol. 1999. V. 32. № 3. P. 643–655.
  • 7. MymA operon of Mycobacterium tuberculosis: its regulation and importance in the cell envelope / A. Singh [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. 2003. V. 227. № 1. P. 53–63.
  • 8. Does the lipR gene of tubercle bacilli have a role in tuberculosis transmission and pathogenesis?/ K.D. Sheline [et al.] //Tuberculosis (Edinb). 2009. V. 89. № 2.
  • 9. Deciphering the biology of Mycobacterium tuberculosis from the complete genome sequence / S.T. Cole [et al.] // Nature. 1998. V. 393. № 6685. P. 537–544.
  • 10. Identification and structural characterization of an unusual mycobacterial monomeromycolyl-diacylglycerol / L. Kremer [et al.] // Mol. Microbiol. 2005.
  • 11. A glycolipid of hypervirulent tuberculosis strains that inhibits the innate immune response / M.B. Reed [et al.] // Nature. 2004. V. 431. № 7004. P. 84–87.
  • 12. Polyketide versatility in the biosynthesis of complex mycobacterial cell wall lipids / T. Chopra [et al.] // Methods Enzymol. 2009. № 459. P. 259–294.
  • 13. Role of the pks15/1 gene in the biosynthesis of phenolglycolipids in the Mycobacterium tuberculosis complex. Evidence that all strains synthesize glycosylated p-hydroxybenzoic methyl esters and that strains devoid of phenolglycolipids harbor a frameshift mutation in the pks15/1 gene / P. Constant [et al.] // J. Biol. Chem. 2002. V. 277. № 41. P. 38148–38158.
  • 14. Regulation of the Mycobacterium tuberculosis hypoxic response gene encoding alphacrystallin/ D.R. Sherman [et al.]// Proc. Natl.Acad. Sci. USA. 2001. V. 98.№ 13. P. 7534–7539.
  • 15. Inhibitionof respirationby nitricoxide induces a Mycobacterium tuberculosis dormancy program / M.I. Voskuil [et al.] // J. Exp. Med. 2003. V. 198. № 5. P. 705–713.
  • 16. Rv3133c/dosR is a transcription factor that mediates the hypoxic response of Mycobacterium tuberculosis / H.D.Park [et al.]// Mol. Microbiol. 2003. V. 48.№ 3. P. 833–843.
  • 17. DevR-DevS isabona fidetwo-component system of Mycobacterium tuberculosis that ishypoxia-responsive in the absence of the DNA-binding domain of DevR/ D.K. Saini [et al.] // Microbiology. 2004. V. 150. № 4. P. 865–875.
  • 18. Mycobacterium tuberculosis DosS isa redox sensor and DosT isahypoxia sensor A. Kumar [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2007. V. 104. № 28. P. 11568–11573.
  • 19. DosT and DevS are oxygen-switched kinases in Mycobacterium tuberculosis / E.H. Sousa [et al.] // Protein Sci. 2007. V. 16. № 8. P. 1708–1719.
  • 20. Mycobacteriumbovis BCG response regulator essential forhypoxic dormancy/ C. Boon [et al.] // J. Bacteriol. 2002. V. 184. № 24. P. 6760–6767.
  • 21. The W-Beijing lineage of Mycobacterium tuberculosis overproduces triglycerides and has the DosR dormancy regulon constitutively upregulated / M.B. Reed [et al.] // J. Bacteriol. 2007. V. 189. № 7. P. 2583–2589.
  • 22. Strains of the East Asian (W/Beijing) lineage of Mycobacterium tuberculosis are DosS/DosT-DosR two-component regulatory system natural mutants / A. Fallow [et al.] // J. Bacteriol. 2010. V. 192. № 8. P. 2228–2238.
  • 23. Siddiqi S., Rusch-Gerdes S. MGIT Procedure Manual. For BACTEC MGIT 960 TB System (Also applicable for Manual MGIT). Mycobacteria Growth Indicator Tube (MGIT) Culture and Drug Susceptibility Demonstration Projects // FIND. 2006. 89 p.
  • 24. Order № 109 by the Ministry of Health from 21.03.2003 ”On improvement of tuberculosis control measures in the Russian Federation”.
  • 25. Pyrosequencing: nucleotide sequencing technology with bacterial genotyping applications / C. Clarke [et al.] // Expert Rev. Mol. Diagn. 2005. V. 5. № 6. P. 947–953.
  • 26. Global phylogeography of Mycobacterium tuberculosis and implications for tuberculosis product development / S. Gagneux [et al.] // Lancet Infect Dis. 2007. V. 7. № 5. P. 328–337.
  • 27. Molecular characteristics of the Mycobacterium tuberculosis LAM-RUS family prevalent in Central Russia / S. Dubiley [et al.] // J. Clin. Microbiol. 2007. V. 45. № 12. P. 4036–4038.

Выпуски